കേരള സർക്കാർ സ്ഥാപിച്ച ജലമേഖലയിലെ ഒരു പ്രധാന ഗവേഷണ സ്ഥാപനമാണ് ജല വിഭവ വികസന വിനിയോഗ കേന്ദ്രം (സെന്റർ ഫോർ വാട്ടർ റിസോഴ്സസ് ഡെവലപ്മെന്റ് ആൻഡ് മാനേജ്മെന്റ്- സി.ഡബ്ള്യു.ആർ.ഡി.എം). സുസ്ഥിര ജല വിഭവവിനിയോഗ മേഖലയിലെ ഗവേഷണ-വികസന ആവശ്യങ്ങൾ തിരിച്ചറിഞ്ഞ് 1978, ഫെബ്രുവരിയിൽ കേരള സർക്കാരിന്റെ ശാസ്ത്ര സാങ്കേതിക നയത്തിന് കീഴിൽ ഒരു സ്വയംഭരണ ഗവേഷണ സ്ഥാപനമായി ജല വിഭവ വികസന വിനിയോഗ കേന്ദ്രം നിലവിൽ വന്നു. 2003-ൽ കേരള ശാസ്ത്ര സാങ്കേതിക പരിസ്ഥിതി കൗൺസിലുമായി (കേരള സ്റ്റേറ്റ് കൗൺസിൽ ഫോർ സയൻസ് ടെക്നോളജി ആൻഡ് എൻവയോൺമെൻറ്) കേന്ദ്രം സംയോജിപ്പിക്കപ്പെട്ടു .